Ses travaux portent généralement sur les enjeux de durabilité et de transition des socioécosystèmes, notamment agricoles et alimentaires. Actuellement, il travaille sur les systèmes alimentaires alternatifs à partir du cas des Caisses alimentaires s'inspirant de la Sécurité sociale de l'alimentation. Il analyse les tensions dans l'articulation des enjeux de durabilité et de transition avec la démocratie, les effets de ces alternatives en termes de durabilité, ainsi que les conditions de leur changement d'échelle. Il mobilise pour cela la théorie de la régulation sociale et la sociologie des systèmes alimentaires alternatifs. Ecologue de formation, il a aussi travaillé sur l'écologie fonctionnelle des forêts tropicales humides, ainsi que sur les pratiques agroécologiques dans la régulation des bioagresseurs.